Σε ορισμένους πάσχοντες από αρρυθμίες, και ιδιαιτέρως σε πάσχοντες από επεισόδια κοιλιακής μαρμαρυγής (τα οποία ανατάσσονται με ηλεκτρικό shock και δεν προλαμβάνονται με φαρμακευτική θεραπεία) συνιστάται η υποδόρια εμφύτευση ενός μικρού απινιδωτή. Πρόκειται για μια ηλεκτρονική συσκευή λίγο μεγαλύτερης σε μέγεθος από τον βηματοδότη. Μέσω της συσκευής αυτής, παρακολουθείται ο καρδιακός ρυθμός και μέσω ειδικών αλγορίθμων, αναγνωρίζεται η παρουσία κακοήθους αρρυθμίας. Οι αρρυθμίες αυτές τερματίζονται είτε με αντιταχυκαρδιακή βηματοδότηση είτε με απινίδωση (shock), αυτόματα.
Η τοποθέτηση αυτόματου απινιδωτή, ενδείκνυται στην πρωτογενή και δευτερογενή πρόληψη του αιφνίδιου καρδιακού θανάτου. Ο απινιδωτής εμφυτεύεται αμέσως κάτω από το δέρμα, όπως και ο βηματοδότης. Σε περίπτωση που κάποιο μέρος της συσκευής μολυνθεί (συνήθως τα καλώδια) προχωρούμε σε αντικατάστασή τους.